Course: Biomechanics and modeling of tissues

» List of faculties » FAV » KME
Course title Biomechanics and modeling of tissues
Course code KME/BMT
Organizational form of instruction Lecture + Tutorial
Level of course Master
Year of study not specified
Semester Winter
Number of ECTS credits 5
Language of instruction Czech
Status of course unspecified
Form of instruction Face-to-face
Work placements This is not an internship
Recommended optional programme components None
Lecturer(s)
  • Sladký Miroslav, Prof. Dr. Ing. DSc.
Course content
1 Basic types of tissues, their constitution, functions, experimental tissue structure analysis 2 Large deformation, kinematics, stress-strain relations, hyperelastic models 3 Rheology of viscoelastic models, creep, relaxation, disspation 4 Introduction to poroelasticity, phenomenological theories, Darcy flow and Biot model 5 lectro-osmosis and diffusion in porous media, basic equations, double layer models 6 Reaction-diffusion processes in tissues, kinetic equations, some enzyme-controlled processes 7 Introduction to the physiology of muscular contraction, Hill and Huxley theories 8 Modeling muscles as 3D continua, application to smooth, skeletal and cardiac muscles 9 Cartillages, fundemantal processes, viscoelasticity, electro-osmosis, multiphase theories 10 Bone tissue structure, compact and trabecular bones, hierarchical arrangement of the bone porosities, poroelastic models, streem generated potetials and mechano-transduction 11 Tissue growth models, application to bones, dynamic load influence 12 Models of tissue perfusion, hierarchical models, application to some organe modeling, deformation influence 13 Methods of material parameters identification, optimization problems, indirect measurements

Learning activities and teaching methods
Lecture, Practicum
  • Contact hours - 52 hours per semester
  • Preparation for an examination (30-60) - 40 hours per semester
  • Graduate study programme term essay (40-50) - 45 hours per semester
prerequisite
Knowledge
orientovat se v oblasti diferenciálních rovnic
orientovat se v oblasti mechaniky kontinua a biomechaniky
orientovat se v oblasti numerických metod a algoritmizace
orientovat se v oblasti tenzorového, diferenciálního a integrálního počtu
vyjmenovat základní anatomické celky lidského těla
orientovat se v oblasti biomechaniky, popsat základní funkce orgánů.
Skills
řešit základní typy diferenciálních rovnic analyticky i pomocí adekvátních numerických metod
řešit problémy a úlohy v mechanice poddajných těles a tekutin
využívat software pro statistické zpracování dat (experimentálních) a jejich grafické zpracování
využívat některý programovací jazyk pro numerické řešení jednodušších úloh z oblasti diferenciálních rovnic a nelineárních algebraických rovnic
Competences
N/A
N/A
N/A
N/A
N/A
learning outcomes
Knowledge
vysvětlit popis velkých deformací tkání a formulace úloh pro počítačové simulace
orientovat se přehledově v modelech svalové kontrakce, měkkých tkáních a kostí
orientovat se přehledově v modelech využitelných pro popis vybraných základních typů tkání
orientovat se v popisu tkáňového růstu a remodelace
popsat elektro-difúzní procesy v tkáních a vysvětlit příslušné modely
Skills
využívat odborných znalostí pro řešení některých jednodušších úloh z oblasti modelování tkání
orientovat se v odborné literatuře zaměřené na modelování tkání a experimentální studie
charakterizovat mechanické vlastnosti tkání
pro daný případ (problém) analyzovat nároky na komplexnost tkáňového modelu, vybrat jeho rozhodující vlastnosti a jevy, které by měl popisovat
formulovat jednodušší úlohy pro simulace mechanicky zatížených tkání
Competences
N/A
N/A
N/A
teaching methods
Knowledge
Interactive lecture
Task-based study method
Skills
Practicum
Individual study
Competences
Students' portfolio
Seminar
assessment methods
Knowledge
Combined exam
Individual presentation at a seminar
Skills
Combined exam
Seminar work
Competences
Combined exam
Seminar work
Recommended literature
  • Cowin. Bone biomechanics.
  • Holzaplfel. Cardiovascular biomechanics.
  • Keener, Sneyd. Mathematical physiology.
  • Křen, Rosenberg. Biomechanika.
  • Marsik. Biotermodynamika.
  • Quarteroni. Model. Bio. Flows ?..


Study plans that include the course
Faculty Study plan (Version) Category of Branch/Specialization Recommended year of study Recommended semester