Předmět: Modelování fyziologických systémů

» Seznam fakult » FAV » KME
Název předmětu Modelování fyziologických systémů
Kód předmětu KME/MFS
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu nespecifikováno
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Vokurka Pavel, prof. Dr. Ing. DSc.
Obsah předmětu
1) Stavba buňky a buněčná mechanika, mikroreologie, rozdělení procesů na buněčné úrovni. 2-3) Úvod do modelování elektrochemických procesů na buněčné membráně, membránové potenciály, kinetika reakcí, transpot a difúze, regulace objemu. Hodggkin-Huxleyův model, dynamika vápníku. 4-5) Buněčný pohyb a buněčné motory. Pohyb podél mikrotubulů (kinesin, dynein) a aktinových filament (myosin). Aktomyosinový pohyb (dělení buněk, svalová kontrakce), protonová pumpa, fyziologie cytoskeletu. 6) Mezibuněčná komunikace, chemické synapse, vedení dendrity, eletrický tok v neuronech, vápníkové vlny, regulace buněčných procesů. 7) Popis fyziologie srdečního rytmu, popis oscilací, pacemakery, arytmie, defibrilace. 8) Modely svalové kontrakce, rozdíly ve fyziologii hladkých a příčně pruhovaných svalů z hlediska modelování. Huxleyův model. 9) Mikrocirkulace v cévním systému, přístupy modelování. Reologie krve, transport kyslíku a jiných látek. 10-11) Fyziologie kardiovaskulárního a lymfatického systému, modely prokrvení tkání. Fyziologie plic, dýchání, termoregulace. 12) Modelování tkáňové přestavby a růstu kostí. Fyziologické procesy, stimulace mechanickým zatížením. 13) Metabolismus hepatocytů a vazba na mikrocirkulaci.

Studijní aktivity a metody výuky
  • Účast na exkurzi [reálný počet hodin - max. 8h/den] - 3 hodiny za semestr
  • Vypracování seminární práce v magisterském studijním programu [5-100] - 20 hodin za semestr
  • Kontaktní výuka - 62 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku [10-60] - 45 hodin za semestr
Předpoklady
Odborné znalosti
orientovat se v oblasti mechaniky kontinua a biomechaniky
vyjmenovat základní anatomické celky lidského těla
orientovat se v oblasti biomechaniky, popsat základní funkce orgánů.
orientovat se v oblasti diferenciálních rovnic
orientovat se v oblasti tenzorového, diferenciálního a integrálního počtu
orientovat se v oblasti numerických metod a algoritmizace
Odborné dovednosti
řešit základní typy diferenciálních rovnic analyticky i pomocí adekvátních numerických metod
řešit problémy a úlohy v mechanice poddajných těles a tekutin
využívat software pro statistické zpracování dat (experimentálních) a jejich grafické zpracování
využívat některý programovací jazyk pro numerické řešení jednodušších úloh z oblasti diferenciálních rovnic a nelineárních algebraických rovnic
Obecné způsobilosti
mgr. studium: samostatně a odpovědně se na základě rámcového zadání rozhodují v souvislostech jen částečně známých,
Výsledky učení
Odborné znalosti
vysvětlit stavbu buňky a základní procesy na buněčné úrovni
popsat elektro-difúzní procesy a kinetiku chemických reakcí v kontextu fyziologických procesů
vysvětlit mezibuněčnou komunikaci, chemické synapse, eletrický tok v neuronech, regulaci buněčných procesů, buněčné motory a fyziologii cytoskeletu.
orientovat se v modelech svalové kontrakce, měkkých tkáních a tkáně kostí
orientovat se v principech tkáňového růstu a remodelace vybraného typu tkání, zejména kostí.
vysvětlit fyziologii srdečního rytmu, popsat oscilace, činnost pacemakerů, arytmii a defibrilaci.
orientovat se v popisu mikrocirkulace v cévním systému, transportu kyslíku a jiných látek.
vysvětlit fyziologii kardiovaskulárního a lymfatického systému, modely prokrvení tkání, fyziologii dýcháním a termoregulaci.
Odborné dovednosti
využívat odborných znalostí pro řešení některých jednodušších úloh z oblasti fyziologie tkání
pro daný případ (problém) analyzovat nároky na komplexnost modelu fyziologického systému, vybrat jeho rozhodující vlastnosti a jevy, které by měl popisovat
orientovat se v odborné literatuře zaměřené na modelování fyziologie tkáňových systémů a zpracování experimentálních studií
formulovat a řešit jednodušší úlohy pro simulace fyziologických procesů v tkáních.
samostatně vyhledávat relevantní informace o aktuálních vědeckých poznatcích v oblasti modelování fyziologických systémů
Obecné způsobilosti
mgr. studium: samostatně a odpovědně se rozhodují v nových nebo měnících se souvislostech nebo v zásadně se vyvíjejícím prostředí s přihlédnutím k širším společenským důsledkům jejich rozhodování,
mgr. studium: srozumitelně a přesvědčivě sdělují odborníkům i širší veřejnosti vlastní odborné názory,
Vyučovací metody
Odborné znalosti
Přednáška založená na výkladu,
Samostudium,
Exkurze, soustředění, výuka v terénu,
Individuální konzultace,
Odborné dovednosti
Přednáška s aktivizací studentů,
Cvičení (praktické činnosti),
Individuální konzultace,
Obecné způsobilosti
Přednáška založená na výkladu,
Cvičení (praktické činnosti),
Hodnotící metody
Odborné znalosti
Kombinovaná zkouška,
Seminární práce,
Odborné dovednosti
Kombinovaná zkouška,
Seminární práce,
Obecné způsobilosti
Seminární práce,
Doporučená literatura
  • Dylevský, Ivan; Trojan, Stanislav. Somatológia 1. Martin : Osveta, 1992. ISBN 80-217-0534-5.
  • Keener, James; Sneyd, James. Mathematical physiology. New York : Springer, 1998. ISBN 0-387-98381-3.
  • Motáň,J. Základy anatomie a fyziologie. Učební texty. ZČU Plzeň, 1997.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr