Předmět: Mikrobiologie 1

» Seznam fakult » FZS » KAZ
Název předmětu Mikrobiologie 1
Kód předmětu KAZ/MIL1
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Dostupnost předmětu Předmět je nabízen přijíždějícím studentům
Vyučující
  • Cimrman Jan, RNDr. Ph.D.
  • Zábranský Petr, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Přednášky 1. Úvod do mikrobiologie a laboratorní základy - Přehled historie mikrobiologie. Zásady péče o laboratorní zvířata. Základy laboratorní práce: provozní řád, bezpečnost, dezinfekce a sterilizace. 2. Patogenita a infekční proces - Patogenní mechanismy. Infekční proces. Virulentní faktory 3. Morfologie a klasifikace mikroorganismů - Morfologie bakteriální buňky. Bakteriální taxonomie. Význam bakterií a virů při vzniku chorob. 4. Antimikrobiální léčba - Antibiotika a chemoterapeutika. Antimikrobiální preparáty. Mechanismy účinku a rezistence 5. Diagnostické metody I - mikroskopie a kultivace. Mikroskopické techniky (nativní preparát, barvení). Kultivační metody (aerobní, anaerobní, selektivní média). Příprava kultivačních médií a ověření sterility. 6. Diagnostické metody II - identifikace mikroorganismů. Biochemické testy. Identifikace bakterií a kvasinek. Latexová aglutinace, imunofluorescence. 7. Diagnostické metody III - testování citlivosti na antibiotika. Disková difúze, MIC. Detekce genů rezistence (např. mecA, ESBL). Interpretace výsledků. 8. Diagnostické metody IV - sérologie. ELISA, TPHA. Detekce antigenů a protilátek. Interpretace sérologických výsledků 9. Diagnostické metody V - molekulární biologie. PCR, RT-PCR, real-time PCR. Elektroforéza. Práce s databázemi (BLAST, GenBank). 10. Infekční onemocnění - prevence a profylaxe. Epidemiologie. Vakcinace. Hygienická opatření. 11. Protiinfekční imunita - část I. Přirozená a získaná imunita. Imunitní odpověď na mikroorganismy. 12. Protiinfekční imunita - část II. Klinické implikace. Imunodeficience a imunopatologie. 13. Mikroflóra člověka a virologie. Mikroflóra - význam, lokalizace. Virologie - základy, priony. 14. Mykologie a parazitologie. Základní poznatky o houbách. Základní poznatky o parazitech. 15. Sepse, perinatální infekce a rezistence. Sepse z hlediska mikrobiologie. Perinatální infekce. Rezistence mikroorganismů Laboratorní cvičení 1. Zásady bezpečnosti práce a ochrany zdraví při práci v mikrobiologické laboratoři. Profesionální a laboratorní infekce. 2. Sterilizace a dezinfekce v mikrobiologii. Validace sterilizace, testování dezinfekčních účinků. 3. Zařízení mikrobiologické laboratoře. Práce s PCR stanicí, ELISA čtečkou, laminárním boxem. 4. Kultivace mikroorganismů a modelové systémy - příprava kultivačních půd, inokulace, práce s tkáňovými kulturami, manipulace s kuřecími zárodky, etické aspekty práce s pokusnými zvířaty. 5. Odběr a transport biologických vzorků do mikrobiologické laboratoře - simulace odběru různých typů vzorků (moč, sputum, výtěry), správné značení, transportní média, uchovávání vzorků. 6. Metody druhové identifikace mikroorganismů I - klasické techniky 7. Metody druhové identifikace mikroorganismů II - moderní techniky 8. Barvicí techniky a mikroskopie - příprava nátěrů, barvení podle Grama a Ziehl-Neelsena, mikroskopie nativních a barvených preparátů, interpretace nálezů. 9. Kultivace a identifikace základních bakteriálních skupin - práce s grampozitivními a gramnegativními koky a tyčkami, testy citlivosti na antibiotika (disková difúze, MIC). 10. Anaerobní mikroorganismy - kultivace v anaerobních podmínkách (anaerostaty, generátory atmosféry), identifikace anaerobních bakterií. 11. Acidorezistentní bakterie a spirochety - barvení acidorezistentních tyček, mikroskopie spirochet, PCR detekce Mycobacterium tuberculosis. 12. Intracelulární patogeny - diagnostika mykoplasmat, chlamydií a rickettsií pomocí PCR, imunofluorescence a ELISA. 13. Diagnostika sexuálně přenosných infekcí - sérologické testy (TPHA, ELISA), multiplex PCR pro detekci více patogenů současně. 14. Diagnostika DNA virů - izolace virové DNA, PCR amplifikace, vizualizace produktů pomocí gelové elektroforézy. 15. Diagnostika RNA virů - reverzní transkripce RNA, RT-PCR, interpretace výstupů (např. SARS-CoV-2, HCV), kvantitativní analýza virové nálože.

Studijní aktivity a metody výuky
Přednáška
  • Kontaktní výuka - 60 hodin za semestr
  • Příprava na souhrnný test [6-30] - 20 hodin za semestr
Předpoklady
Odborné znalosti
prezentovat základní znalosti z biologie živých organismů
Odborné dovednosti
specifické dovednostní předpoklady nejsou vyžadovány
Obecné způsobilosti
bc. studium: své učení a pracovní činnost si sám plánuje a organizuje,
Výsledky učení
Odborné znalosti
na základní úrovni popíše morfologii mikroorganismů a vysvětlí jejich patogenní působení na člověka,
charakterizuje fyziologii bakteriálních kultur a vysvětlí metabolismus mikroorganismů
popíše účinky antibiotik na mikroorganismy
vyjmenuje zásady prevence a profylaxe infekčních onemocnění
popíše druhy barvících technik v mikrobiologické laboratoři
Odborné dovednosti
ovládá základy bakteriální taxonomie
odebírá a transportuje biologický vzorek do mikrobiologické laboratoře
vyhodnocuje porušení zásad bezpečnosti při práci v mikrobiologické laboratoři
dodržuje zásady ochrany zdraví při manipulaci s biologickým vzorkem
vyhodnocuje způsob rozmnožování v laboratorních podmínkách s použitím kultivačních půd, tkáňových kultur, kuřecích zárodků nebo pokusných zvířat
určí metodu druhové identifikace mikroorganismů (světelná mikroskopie, kultivace, biochemické, imunologické a molekulární metody)
Obecné způsobilosti
bc. studium: srozumitelně a přesvědčivě sdělují odborníkům i laikům informace o povaze odborných problémů a vlastním názoru na jejich řešení,
Vyučovací metody
Odborné znalosti
Přednáška založená na výkladu,
Výuka podporovaná multimédii,
Odborné dovednosti
Laboratorní praktika,
Obecné způsobilosti
Přednáška založená na výkladu,
Laboratorní praktika,
Hodnotící metody
Odborné znalosti
Test,
Průběžné hodnocení,
Odborné dovednosti
Demonstrace dovedností (praktická činnost),
Obecné způsobilosti
Demonstrace dovedností (praktická činnost),
Test,
Doporučená literatura
  • DRNKOVÁ, Barbora. Mikrobiologie, imunologie, epidemiologie a hygiena pro zdravotnické obory.. Praha : Grada, 2019. ISBN 978-80-271-0693-6.
  • GOERING, Richard V., DOCKRELL, Hazel M., ZUCKERMAN, Mark, ROITT, Ivan M. a Peter L. CHIODINI. Mimsova lékařská mikrobiologie. 5. vydání. Editor Jaroslav JULÁK.. Praha: Stanislav Juhaňák - Triton, 2016. ISBN 978-80-7387-928-0.
  • HURYCH, Jakub, ŠTÍCHA, Roman et al. Lékařská mikrobiologie - repetitorium.. Praha: Triton, 2021. ISBN 978-80-7553-976-2.
  • KOLÁŘOVÁ, Libuše et al. Obecná a klinická mikrobiologie.. Praha : Galén, 2020. ISBN 978-80-7492-477-4.
  • MELICHERČÍKOVÁ, Věra. Sterilizace a dezinfekce. Druhé, doplněné a přepracované vydání.. Praha: Galén, 2015. ISBN 978-80-7492-139-1.
  • VOTAVA, Miroslav a kol. Lékařská mikrobiologie - vyšetřovací metody.. Brno: Neptun, 2010. ISBN 978-80-86850-04-7.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr